Образователната история на село Юнаците започва през 1888 година с откриването на училище „Св. Иван Рилски". Първоначално учебните занятия се провеждат в местна бакалница, след което училището се премества в старата църква, а по-късно в сграда до кметството.
Официалното откриване на училището се осъществява през 1902 година с главен учител Ангел Димитров Такев и учителка Евгения Колчакова. Тогава учебното заведение разполага с четири отделения от първи до четвърти клас. През 1915 година образователната институция разширява дейността си с откриването на прогимназиални класове, но поради липса на учители, през учебната 1917/1918 година временно преустановява своята дейност.
През учебната 1919/1920 година Народно първоначално училище с. Хаджилий възобновява работа с главен учител Ангел Димитров, който ръководи учебния процес до 1923 година. В преподавателския състав по това време влизат Иван Благов, Слава Георгиева и Мария Видинлиева. Първоначално се откриват само първи и втори клас, а през септември същата година се добавят трети и четвърти клас от началния етап.
На 28 септември 1920 година се взема решение за построяване на нова училищна сграда. През учебната 1922/1923 година отново се открива прогимназия, която обаче през 1925/1926 година временно прекратява дейността си.
През учебната 1930/1931 година се открива Първи прогимназиален клас с учител Стефания Т. Ангелова от град Пазарджик. През следващата 1931/1932 година се открива и Втори прогимназиален клас с учител Любен Стоянов Сираков.
От 1932 до 1940 година главен учител е Стоян Димитров Попов. След него длъжността, вече преименувана на "директор", заема Костадин К. Германов.
През учебната 1939/1940 година „Юнашко народно основно училище" отново открива прогимназия с директор Стоян Георгиев Велинов. През 1940/1941 година се открива и Трети прогимназиален клас под ръководството на директора Костадин Германов, който заема тази длъжност до 1943 година. След него директор отново става Стоян Попов до 1945 година.
В следвоенния период училището се ръководи последователно от Веса Георгиева (1945-1947) и Ангел Найденов от с. Величково (1947-1950). До 1950 година училището носи името НОУ „Св. Иван Рилски", а след това е преименувано на Основно училище „Христо Ботев", име, което се запазва до днес.
През следващите години директори на училището са: Иванка Димова (1950/1951), Петрунка Царска (1951/1952) и Костадин Папазов (1953/1954). През 1956 година училището е електрифицирано, което значително подобрява условията за обучение.
През учебната 1959/1960 година за директор е назначен Петър Ангелов Спасов. За първи път през 1960 година, на 3 март, се чества патронният празник на училището. През учебната 1969/1970 година се отпускат средства за построяване на ново крило на училищната сграда, включващо шест класни стаи и две хранилища.
От 1969 до 1975 година директорската длъжност се заема последователно от Димка Иванчева, Пенка Кацарова и Илия Рошлев. В периода 1975-1988 година директор е Мария Георгиева, а от 1988 до 1992 година – Делчо Николов Енев.
В по-новата история на училището, от 1993 до 2013 година, директор е Тодор Костадинов Тодоров. От 2013 година до настоящия момент директорският пост се заема от Недялка Иванова Бодурова.